Деревянный Никольский храм впервые упоминается в документах как «строение патриаршее» в 1585 г. Со временем деревянная Никольская церковь обветшала. Взамен попечением патриарха Адриана за два года была построена каменная. Патриарх сам выбрал место для будущего храма и благословил его. Торжественное освящение нового храма в честь святителя Николая состоялось 30 июня 1694 года, о чем свидетельствует сохранившаяся поныне надпись на доске, размещенная при входе.
В первой четверти XIX века к западной части храма была пристроена трехъярусная шатровая колокольня. Возобновлена и была освящена церковь митрополитом Московским Филаретом (Дроздовым) 22 июля 1861 года. Известно, что 27 июля 1918 года в Никольском храме с. Пушкино служил воскресную литургию святитель Тихон (Беллавин), патриарх Московский. В годы советских гонений храм был закрыт с 1940-го года по 1947. В июле 1947 года Никольский храм был возвращен верующим и на протяжении нескольких десятилетий он оставался в числе немногих действующих храмов в Пушкинском районе.
14 декабря 2014 года, по благословению митрополита Крутицкого и Коломенского Ювеналия, Архиепископ Можайский Григорий возглавил Божественную литургию в Никольском храме г. Пушкино по случаю 320-летнего юбилея старейшего храма Пушкинского благочиния.
Под звон колоколов у ворот храма Владыку Григория встречали благочинный церквей Пушкинского округа протоиерей Иоанн Монаршек, настоятель храма протоиерей Иоанн Герасимович, глава Пушкинского муниципального района А.В. Тропин, глава города Пушкино С.И Гулин, многочисленные прихожане и воспитанники воскресной школы, которые преподнесли архипастырю цветы.
В этот праздничный день Владыке сослужили благочинный церквей Пушкинского округа протоиерей Иоанн Монаршек (мл.), благочинный церквей Ивантеевского округа протоиерей Иоанн Монаршек, благочинный церквей Мытищинского округа протоиерей Димитрий Оловянников, настоятель храма протоиерей Иоанн Герасимович и клирики храма.
Благословенные грамоты митрополита Ювеналия получили жертвователи и прихожане, активно участвующие в жизни прихода.
Архиепископа Григория на Пушкинской земле приветствовали глава Пушкинского муниципального района А.В. Тропин и глава города Пушкино С.И Гулин.
Затем архиепископ Григорий с гостями прошли в дом причта и осмотрели классы воскресной школы для детей.